药学院自成立以来，理论与实验相结合，各研究组紧密合作，充分发挥药物化学、计算机科学、计算生物学、分子/细胞生物学及药理学等学科交叉优势，结合我校化学合成等传统学科优势，加大药物及靶标的发现工作，开展源头创新，并已取得了优异的成果。在学校《交叉学科与重大项目培育基金》资助下，由李洪林教授负责，药学院已初步建立了集成药物设计、化学信息及计算系统生物学的药物及靶标发现计算和相关数据库平台；学院内各研究方向紧密合作，进一步完善了药物及靶标发现实验平台的流程化建设。目前基于该平台，学院在创新药物研究方面进展迅速。
近期，药学院李剑副教授、黄瑾副教授、李洪林教授和徐玉芳教授研究组紧密合作，连续在美国化学会的《药物化学杂志》（journal of medicinal chemistry）发表3篇研究论文，分别报道了他们在基于心血管疾病治疗靶标roha发现小分子抑制剂先导及优化、基于分子形状和化学特征的三维相似性计算平台发现全新结构的rsk2激酶抑制剂、基于反向药效团匹配的在线靶标预测平台成功 “锁定”潜在作用靶标fgfr-1激酶方面的最新研究进展。
美国化学会的《药物化学杂志》创刊于1957年，是化学类药物研发领域中影响力和引用频率最高的期刊。初步统计，从2006至2010这5年期间，中国大陆地区研究者在该刊上发表论文86篇（其中高校发表论文数目为41篇）。而从2009年开始至2010年底，我校药学院在该期刊上已发表5篇研究论文。2011年初至5月底，药学院已有3篇论文被该刊发表，有力地提升了我校在药物化学领域的学术影响力和学科地位。这表明药学院通过建设药物及靶标发现平台，开展创新药物研究的交流合作模式可为药物研发发挥积极稳定的作用。同时，这也标志着药学院在药物化学领域的科研水平迈上了新的台阶，将为药学院逐步占领药物研发的制高点，推进相关重大疾病治疗成果的进一步转化，推动我校医药研究领域的创新性发展奠定坚实的基础。
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